In de kerk is nu de geheel gerestaureerde orgelkas met frontpijpen te zien. Er worden plannen gemaakt voor een nieuw orgel dat bij de Niehoff-kas uit 1549 past. 

Steenkuyl vervaardigde een nieuw pneumatisch binnenwerk in de oude kas van Niehoff, zoals ook Barentsz en Duyschot in 1683 al hadden gedaan. De frontpijpen zijn uit 1683.

Het binnenwerk met onderstaande dispositie, uiteindelijk in 1990 tot stand gekomen, is in de kerk opgeslagen in afwachting van een nieuwe bestemming.